虽然三个体系有相同或相似的要素结构，但是它们也有许多不同点，主要是：
a. 三个体系的适用对象和目的不同。
QMS主要是以产品为对象，建立质量管理体系，通过对体系持续改进及预防不合格来满足顾客要求，以达到顾客满意为目的。EMS是以组织的环境因素为对象，建立环境管理体系，通过体系的运行和持续改进，规范组织的环境管理达到改善组织环境绩效的目的，满足社会的要求。而OHSMS则是以企业的危险源为对象，建立职业健康安全管理体系，通过体系的运行和持续改进，规范组织的职业健康安全管理和达到改善组织职业健康安全绩效的目的，满足组织员工和相关方对职业健康安全的要求。
b. 三个体系中有的要素名称相同或相近，但内容差别很大。例如，三个体系中均有“方针”和“目标”这两个要素，但质量方针的内容和环境方针的内容以及职业健康安全方针的内容全然不同。同样的道理，质量目标的内容和环境目标、职业健康安全目标的内容也不一样。
c. 三个体系的结构要素并不一一对应。GB/T19001标准中的许多条款要求是GB/24001和GB/T28001中所没有的;反过来，GB/24001和GB/T28001中的一些要素也是GB/T19001中所没有的。
d. 三个体系分别满足不同相关方的要求。GB/T19001标准在于帮助组织建立质量管理体系，其目的是满足顾客和其他相关方当前和潜在的要求和期望，达到顾客满意。GB/24001标准是针对组织的活动、产品或服务的环境影响建立环境管理体系，其目的是要满足众多相关方要求，同时还要满足社会对环境保护的要求。GB/T28001标准是针对组织的活动、产品或服务中的危险源和职业健康安全风险，建立职业健康安全管理体系，其目的是旨在使组织能够控制职业健康安全风险并改进其绩效，消除或减少因组织的活动而使员工和其他相关方可能面临的职业健康安全风险，满足员工和其他相关方对职业健康安全的要求。
ISO9000族的基本要求
1)控制所有过程的质量
ISO9000族标准是建立在“所有工作都是通过过程来完成的”这样一种认识基础上的。一个组织的质量管理就是通过对组织内各种过程进行管理来实现的，这是ISO9000族关于质量管理的理论基础。当一个组织为了实施质量体系而进行质量体系策划时，首要的是结合本组织的具体情况确定应有哪些过程，然后分析每一个过程需要开展的质量活动，确定应采取的有效的控制措施和方法。
2)控制过程的出发点是预防不合格。
在产品寿命周期的所有阶段，从最初的识别市场需求到最终满足要求的所有过程的控制都体现了预防为主的思想。例如：
---控制市场调研和营销的质量，在准确地确定市场需求的基础上，开发新产品，防止盲目开发而造成不适合市场需要而滞销，浪费人力、物力。
---控制设计过程的质量。通过开展设计评审、设计验证、设计确认等活动，确保设计输出满足输入要求，确保产品符合使用者的需求。防止因设计质量问题，造成产品质量先天性的不合格和缺陷，或者给以后的过程造成损失。
---控制采购的质量。选择合格的供货单位并控制其供货质量，确保生产产品所需的原材料、外购件、协作件等符合规定的质量要求，防止使用不合格外购产品而影响成品质量。
---控制生产过程的质量。确定并执行适宜的生产方法，使用适宜的设备，保持设备正常工作能力和所需的工作环境，控制影响质量的参数和人员技能，确保制造符合设计规定的质量要求，防止不合格品的生产。
---控制检验和试验。按质量计划和形成文件的程序进行进货检验、过程检验和成品检验，确保产品质量符合要求，防止不合格的外购产品投入生产，防止将不合格的工序产品转入下道工序，防止将不合格的成品交付给顾客。
---控制搬运、贮存、包装、防护和交付。在所有这些环节采取有效措施保护产品，防止损坏和变质。
---控制检验、测量和实验设备的质量，确保使用合格的检测手段进行检验和试验，确保检验和试验结果的有效性，防止因检测手段不合格造成对产品质量不正确的判定。
---控制文件和资料，确保所有的场所使用的文件和资料都是现行有效的，防止使用过时或作废的文件，造成产品或质量体系要素的不合格。
---纠正和预防措施。当发生不合格(包括产品的或质量体系的)或顾客投诉时，即应查明原因，针对原因采取纠正措施以防止问题的再发生。还应通过各种质量信息的分析，主动地发现潜在的问题，防止问题的出现，从而改进产品的质量。
---全员培训，对所有从事对质量有影响的工作人员都进行培训，确保他们能胜任本岗位的工作，防止因知识或技能的不足，造成产品或质量体系的不合格。 |
